#!/bin/bash
#                        fichier script shell

#                        une ligne commençant par #PBS est une commande PBS
#                        une ligne commençant par # est un commentaire

#                        le shell utilisé par PBS pour interpréter 
#                        le fichier est bash
#PBS -S /bin/bash

#                        nom du job (facultatif)
#                        15 caractères maximun
#PBS -N JobName          

#                        par défaut, les flux "output" et "error" sont envoyés
#                        dans des fichiers situés dans le répertoire de 
#                        travail (PBS_O_WORKDIR) et dont les noms sont :
#                          job_name.osequence_number  <-  output 
#                          job_name.esequence_number  <-  error
#                        où job_name est le nom du job et sequence_number et 
#                        le numéro du job qui est assigné lors de la soumission
#                        On peut changer les noms par défaut en utilisant les 
#                        commandes suivantes :
#  #PBS -o stdout_file
#  #PBS -e stderr_file

#                        Pour éviter d'avoir trop de fichiers, on peut 
#                        regrouper les flux "output et "error" dans un seul 
#                        fichier :
#PBS -j oe

#                        PBS peut envoyer des informations sur l'état du job 
#                        par email :
#                        un simple caractère "n" (pas de mail)
#  #PBS -m n
#                        un ou plusieurs caractères :
#                        "a" envoi email si le job est avorté,
#                        "b" envoi email lorsque  le job débute
#                        "e" envoir email lorsque le job se termine
#  #PBS -m abe
#  #PBS -m ae

#                         l'adresse email est spécifié par la commande
#  #PBS -M cros@iup.univ-evry.fr

#                        ressources demandées : 
#                        2 noeuds               : nodes=2
#                        2 processeur par noeud : ppn=2
#PBS -l nodes=2:ppn=2

#                        création des fichiers de configuration pour mpi
#                        détermination du nombre de noeuds et processeurs 
#                        NE PAS MODIFIER CES LIGNES
nodes=`cat $PBS_NODEFILE`
nnodes=`wc $PBS_NODEFILE | awk '{print $1}'`
confile=~/ip.$PBS_JOBID.conf
touch $confile
j="init"
for i in $nodes
do
if [ $j != $i ]
then echo "$i.alineos.net:2" >> $confile
fi
j=$i
done
#                        FIN d'INTERDICTION DE MODIFICATION

#                        PBS_O_WORKDIR correspond au répertoire où a été lancé 
#                        le script, affichage pour vérification :
echo $PBS_O_WORKDIR

#                        déplacement dans le répertoire où se trouve 
#                        l'exécutable
cd $PBS_O_WORKDIR        

#                        lancement du calcul
echo "début du calcul à `date`"
/usr/local/mpich-intel/bin/mpirun -np $nnodes -machinefile $confile test_mpi
echo "fin du calcul à `date`"

#                        la même chose mais avec redirection des impressions
#                        dans un fichier
echo "début du calcul à `date`"
/usr/local/mpich-intel/bin/mpirun -np $nnodes -machinefile $confile test_mpi &> test.out2
echo "fin du calcul à `date`"

#                        effacement du fichier de configuration
/bin/rm -f $confile